El esqueleto de las serpientes esta fuertemente osificado y esta conformando: un cráneo, la columna vertebral, las costillas y, a veces, rudimentos de pelvis en la familia boidae.

El esqueleto de las serpientes ha sufrido grandes variaciones evolutivas, ha perdido las cinturas escapulares y pélvicas, así como la involución total del esternón. Algunas familias (Pythonidae y Boidae) presentan estructuras óseas vestigiales de los miembros pelvianos, que externamente se observan en forma de ganchos o espolones que utilizan durante la cópula para agarrarse a la pareja. La pérdida del esternón y de la cintura escapular hace que las costillas a este nivel no estén fijadas a ninguna estructura que las inmovilice, facilitando también la dilatación esofágica. Las diferencias entre las costillas y vértebras de las diferentes regiones corporales son escasas. La autotomía sólo la presentan algunas especies de Colubridae.

El cráneo de las serpientes se caracteriza por la movilidad de ciertas estructuras óseas: el hueso cuadrado articula con la mandíbula y con el arco palatomaxilar. La sínfisis intermandibular no existe tal como la conocemos en aves y mamíferos: los cuerpos de la mandíbula no están soldados el uno con el otro , sino que el animal los puede separar para dilatar el diámetro de la boca ya que están unidos mediante ligamentos de naturaleza elástica con gran capacidad de distensión.

Los dientes del maxilar se sitúan formando cuatro filas que se asientan sobre los huesos maxilar, palatino, pterigoides y premaxilar. En general, no presentan grandes variaciones morfológicas con relación a su localización, forma y tamaños. Los dientes se reemplazan continuamente a lo largo de toda la vida del animal. Las especies con grandes colmillos presentan un pliegue a modo de funda en su mucosa oral para proteger a estos cuando no están siendo usados: Viperidae puede doblar sus colmillos caudodorsalmente, quedando acostados y envainados cuando la boca está cerrada; Colubridae y Elapidae presenta sus colmillos estáticos, sin poder doblarse cuando la boca está cerrada.

-         Columna vertebral flexible, donde cada vértebra posee una costilla a cada lado.
-         Algunas especies tienen vestigios de pelvis.
-         No poseen esternón.

 Los huesos de la cabeza no están soldados en su totalidad, sino que existen algunas uniones con ligaduras flexibles. La mandíbula y el cráneo no se articulan directamente sino a través del hueso cuadrado; esta característica hace posible que las serpientes puedan ingerir presas de mayor dimensión que su cabeza

 -         Los dientes son generalmente pequeños (excepto Familia Boidae), filosos y curvados hacia atrás, de modo de impedir que la presa retroceda una vez atrapada. No cumplen función masticatoria.

-         Algunas familias han transformado las glándulas salivares, en glándulas para la inoculación del veneno que vierten; esto lo logran a través de dientes especializados (colmillos) surcados o acanalados, que trasladan el veneno hasta la víctima.