Antes de escanear cualquier original, límpialo concienzudamente. Quizás pienses: "bah!, luego lo arreglo con el tampón y listo". Sí, tienes razón, se puede limpiar con el tampón, pero la cuestión no es esa, sino cuanto tiempo se tarda. Piensa que aproximadamente te va a llevar 5 veces más tiempo retocar un pelo que limpiarlo. Y eso sin contar con la suciedad que puede haber en el cristal del escáner (suponiendo que es de los planos).

Por otra parte, es muy útil que uses unos guantes para manejar la película, como esos que llevan los operarios de laboratorios. Te evitará manchar la película con tus huellas dactilares.
Ni que decir tiene que se da por supuesto que mantienes una cierta pulcritud en la mesa de trabajo. Cuanto más sucia esté, más rápidamente se volverán a ensuciar tanto el escáner como los originales.