Los materiales geológicos, su disposición y la morfología resultante de la actividad de los agentes naturales y antrópicos son los responsables de la aparición de  este ecosistema húmedo tan complejo.

Las tablas están enclavadas en la Llanura Manchega Occidental, cerca se hallan los montes de Toledo, terrenos volcánicos de los Campos de Calatrava. Los materiales característicos de la Llanura manchega son sedimentarios de origen continental (dolomías, gravas, yesos,...), que dan lugar a una morfología muy peculiar: cauces fluviales poco definidos, llanuras de inundación muy extensas...

Determinado así que las Tablas sean un humedal de llanura de inundación con numerosas descargas de agua subterránea. También se debe al efecto de los antiguos molinos, situados a lo largo de los ríos, que contribuían a mantener embalsada el agua durante casi todo el año.

Los materiales geológicos que rellenan las tablas están ligados al agua, procedentes de la actividad fluvial (arenas, limos...) de inundaciones y aguas subterráneas (limos y mucha turba) o del desarrollo de una abundante vegetación hidrófila que provoca una acumulación de materia orgánica: la turba. Principalmente son restos de carrizo y masiega con un bajo grado de descomposición. Las turberas pueden  sufrir combustiones y generar incendios y son las responsables de la colmatación de la cubeta. También hay sales y calizas que rellenan las islas, arenas de origen eólico que forman 2 cordones de dunas que se unen hacia el Este y materiales aportados por el río Guadiana, y el río Azuer. En la actualidad los procesos geológicos siguen actuando en las tablas modificando el paisaje continuamente por las condiciones climáticas y antrópicas que actúan sobre él.