Las tablas tiene un clima templado-frío continental con poca influencia atlántica: pluviosidad más bien escasa y temperaturas elevadas en verano. Las lluvias se concentran en invierno, otoño y primavera. Predominan los vientos del oeste, sudoeste y nordeste y en general se dan altas presiones. Las temperaturas oscilan de los 43º de julio y -12º en enero.

Presenta unas condiciones distintas a sus alrededores debido a la presencia de agua y abundante vegetación, ocasionando una mayor humedad y por tanto periodos frecuentes de nieblas. Que sea un ambiente fluctuante provoca que haya grandes diferencias de inundación entre  la primavera y el final del estío lo que les confiere unas características muy valiosas desde el puno de vista ambiental. Esas fluctuaciones son las responsables de una fauna y flora muy peculiar ya que a lo largo de la historia se han ido adaptando a estas condiciones. Junto a la acción del hombre esas cantidades de lluvia han ido cambiando el tipo de ecosistema acuático hasta tener el actual: un ambiente mixto de río y lago, con una tendencia de disminución de la pluviosidad, lo que provoca la dependencia del parque al aporte hídrico del río Gigüela.