Un nuevo fenómeno surgió dentro de la iglesia cristiana pero estos eran de índole teológico. La primera controversia surgió sobre la doctrina de la Trinidad. Tenía como contrincantes a Arrió (318 d.C), prebistero de Alejandría y su opositor Atanasio. En el concilio de Nicea, Bitinia (325 d.C) triunfo la posición de Atanasio.

Luego vino una controversia sobre la naturaleza de Cristo. El concilio de Constantinopla (381 d.C) resuelve esta cuestión. Y la controversia más extensa de este periodo fue sobre cuestiones al respecto de la relación de pecado y la salvación. Las dos posiciones contrarias estaban representadas por Pelagio (410d.C) y el mayor teólogo de la iglesia de su tiempo. San Agustín. El concilio de Cartago (418d.C) le da el respaldó a la doctrina de Agustín.

En este periodo aparece el movimiento monástico, que procuraba la búsqueda de la espiritualidad en la soledad. Este movimiento  floreció mucho en Egipto y tuvo como principal  figura a San Antonio (320 d.c). A estos se les llamo "anacoreta" y a las comunidades "cenobitas". Benedicto organiza bajo forma de ley los monasterios de Occidente promulgada en el (529 d.c).