En Dinamarca, los campos de remolachas fueron infectadas por el virus Rizomania por la aplicación de lodos de plantas depuradoras en grandes extensiones. Este virus, lo mismo que otras enfermedades infecciosas de las plantas, sobrevive en las plantas depuradoras [24].

Se une esto al miedo al BSE por la transmisión de los priones al ganado durante el uso del compost.Los desechos orgánicos domésticos son caldo de cultivo y los composts que no llegan a la madurez contienen enormes cantidades de plastificantes tóxicos del tipo DEHP [25], de bacterias, virus y endotoxinas y presentan riesgos reales para el empleo de las plataformas de compostaje y para los usuarios [26] .

El problema comienza con los recipientes usados para desechar los residuos domésticos de cocina ('Biotonne', donde se realiza una selección de materiales para reciclar) que a menudo son causa de problemas para los asmáticos y los alérgicos.

En los estudios hechos en la Universidad de Wageningue [27] se demostró que después de una semana se desarrolla una concentración casi el doble más alta de hongos y bacterias que en los tarros de basura normales o en basura que no ha sido seleccionada.

En los países Escandinavos, donde las enfermedades graves de las vías respiratorias (alveolitis), fueron detectados valores límites para la concentración de microbios en el aire del ambiente de las plataformas de compostaje, y se acaban de publicar.

La situación es similar para la aplicación de abonos de plantas depuradoras sobre los campos donde los vecinos demandaron ante la justicia por problemas respiratorios graves después de las aplicaciones [28].

En Luxemburgo las prescripciones del ITM para las instalaciones de compostaje y publicadas en 2005 toman en cuenta los riesgos biológicos de estas instalaciones sin precisar, empero, los valores límites de exposición.

También en Alemania están concientes del problema y los riesgos que representan para las 4000 personas empleadas en los centros de compostaje:  los virus, bacterias, legionellas [29], hongos y endotoxinas contenidas en el aire de estos centros [30].

En algunas plantas de compostaje han realmente constatado un inesperado ataque en las vigas del hangar que han requerido programas anticorrosión.

Se han medido también fuertes concentraciones de tricloroetileno y de tetracloroetileno alrededor de las plataformas de compostaje [31], lo mismo que de benceno.