Es la mezcla homogénea en condiciones de asepsia del inoculo o semilla con el substrato. Para una siembra eficiente debe tomarse en cuenta, además de la cepa y del substrato, el estado fisiológico del organismo, la tasa de inoculación y una higiene rigurosa.

Una vez terminada la siembra, se debe cerrar el recipiente para evitar contaminaciones y la pérdida de humedad del substrato, así como para permitir que se incremente la concentración de CO2 en el recipiente. Estas condiciones son necesarias para facilitar un rápido crecimiento y la colonización del substrato por el hongo. Se recomienda que entre el substrato y el nudo (si se usa bolsa) quede un espacio suficiente para permitir que cuando se haga el picado del plástico no se toque el substrato.

Al bloque hongo-substrato así formado se le denomina tronco sintético o pastel.