Más del 10% de las especies de aves anidan en colonias. Una colonia de anidación es un sitio donde decenas o cientos de aves deciden anidar, en ocasiones en un espacio pequeño. Muchas aves acuáticas anidan de esta manera. La ubicación de una colonia puede deberse a la presencia de pocos sitios seguros para anidar, a la existencia de un sitio cerca de una fuente abundante de comida o a la conjunción de estos dos factores.

Anidar en colonias tiene sus ventajas: los depredadores pueden ser detectados más facilmente y así se avisa a los otros del peligro; además, mientras más aves haya, menor es la probabilidad de que el nido propio sea el atacado. Por eso, los sitios más disputados para anidar se encuentran en el centro de la colonia. Otra posible ventaja es que los padres pueden seguir a otros que parezcan conocer dónde hallar comida. En otras palabras, las colonias fungen como centros de información.

Entre los aspectos negativos de anidar en un colonia está la alta competencia por espacio, la posibilidad de que haya robo de material y parasitismo de nidos y el gran número de ácaros y otros parásitos que pueden multiplicarse allí.

La sensibilidad de las aves a la presencia humana tiene que ser considerada antes de acercarse a cualquier colonia de anidación para evitar el abandono por parte de los padres o algún accidente para los pichones.