Usos prácticos de msdos:

Renombrar y convertir archivos
Borrar archivos de manera masiva
Crear archivos con formato simple
Obtener información del sistema
Modificar rápidamente fecha y hora del sistema
Abrir y ejecutar programas
Formatear una unidad
Reparar unidades.
Mover un conjunto de archivos
Bootear el sistema
Eliminar virus
Obtener rutas y arbol de rutas de archivos
Programar pequeños programas
Compilar archivos (por ejemplo en java).
Un poco de hack. ;)
Automatizar tareas
Subir archivos a la red
Conectarse con otro equipo
etc...

En fin, la principal utilidad de msdos es ejecutar funciones de forma masiva y sin tener que esperar a la interfaz gráfica de windows.