Se crea un nuevo archivo real que centraliza los documentos de Castilla en principio, y el reino creado por Carlos V después. Este es el Archivo de Simancas. La corte de Castilla era más itinerante. El rey se movía, y con él se movía el archivo. A veces se depositaba en monasterios. Juan II es el primer rey que tiene un objetivo claro. Decidió depositar sus papeles en el castillo de la Mota en Medina del Campo. Felipe IV destinó como posible archivo central el Alcázar de Segovia. En época de los Reyes Católicos, el Cardenal Cisneros hizo una proposición para crear un archivo central. En 1521, se quema en Burgos el archivo de García de la Mota.

El 5 de mayo de 1545 se nombra archivero al licenciado Catalán, y se le ordena recoger los papeles, controlar las llaves, y se incluye al alcaide del Castillo de Simancas, que era responsable junto con el archivero de dicho archivo.

Se empiezan a recibir papeles. En 1561, se nombra a Diego de Ávila como archivero. Era un experto en administración y papeles. Ayala piensa que no se debe copiar el sistema de organización de un archivo.

Se nombra por primera vez el principio de procedencia. Sus obligaciones y titulación eran:

--Secretario de Su Majestad.
--Salario muy alto (100.000 maravedíes anuales).
--Recoger la documentación.
--Buscar los documentos que no enviaban.
--Instalar los documentos adecuadamente.
--Confeccionar inventarios.
--Copiar los documentos.
--Informar sobre los documentos del archivo.
--Revisar y vigilar las obras de la fortaleza.