Tamaño y volumen. Debido a que los escáneres de cama plana están diseñados para manejar documentos de tamaño carta, ocupan una gran cantidad de espacio del escritorio, aunque algunos modelos recientes apenas son más grandes que el papel tamaño carta (8,5" x 11") que utilizan como tamaño máximo.

Limitaciones de los medios reflejantes. Los escáneres de cama plana más económicos no incluyen adaptadores para transparencias, pero la mayoría de los de rango medio o alto tiene adaptadores opcionales para negativos y diapositivas de 35mm y más grandes. La calidad es muy alta al digitalizar negativos de 4" x.5" y mayores. (Yo he digitalizado cientos de negativos de vidrio de la época de 1920 para un proyecto de archivo universitario). Sin embargo, debido a las limitaciones de la resolución óptica, no son la mejor opción para negativos y diapositivas pequeños.