Dios va a ser la garantía de la existencia de la realidad, de un mundo donde las ideas de la mente tienen correspondencia fuera de ella, en la realidad. Ya que si es bueno y veraz no nos creó para burlarse de nosotros. Aunque su existencia no puede garantizar que todas nuestras ideas existan, sino de la existencia de la extensión y el movimiento, las cualidades primarias: la materia sometida a las leyes de la mecánica (propio de los hombres como producto de su entendimiento), las cualidades secundarias: colores, olores, etc. cualidades subjetivas percibidas a través de los sentidos (en animales y hombres).

            Realiza una fantástica estructura de la realidad, a la que divide en tres esferas básicas:

                  1. dios como sustancia infinita, res infinta.
                  2. yo (pensamiento y libertad) como sustancia presente, res cogitans.
                  3. mundo (materia sometida a las leyes mecanicistas) como sustancia extensa, res extensa.

                Aunque Descartes define sustancia como todo aquello que existe de forma que no necesita de ninguna otra cosa para existir, denomina al yo y al mundo sustancia como forma de subrayar su independencia, salvaguardar la independencia del yo frente al mundo, al cuerpo. El mundo es una máquina no hay lugar para la libertad, por ello lo separa del hombre, del yo, del alma. Por lo que establece un dualismo radical entre cuerpo y alma.